Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SALL3Q9BXA9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms