Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP4Q9BWG4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms