Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP9Q99956 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms