Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms