Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDRT15Q96T59 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDRT15Q96T59 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms