Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC38A2Q96QD8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms