Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms