Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMD3Q96D46 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms