Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3DQ96BQ1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3DQ96BQ1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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FAM3DQ96BQ1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3DQ96BQ1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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