Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMIGD2Q96BF3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms