Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HGDQ93099 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HGDQ93099 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HGDQ93099 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms