Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113Q902F9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113Q902F9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms