Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SEMA6DQ8NFY4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEMA6DQ8NFY4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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