Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms