Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC80Q76M96 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms