Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TUBA1AQ71U36 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA1AQ71U36 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms