Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SUSD1Q6UWL2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms