Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TSSK4Q6SA08 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms