Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZBED9Q6R2W3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms