Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TUBA3EQ6PEY2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms