Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRNP1Q6NT89 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms