Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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