Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF220Q5VTB9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF220Q5VTB9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms