Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODF2Q5BJF6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF2Q5BJF6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms