Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC38Q502W7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC38Q502W7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms