Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM259Q4ZIN3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms