Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KRTAP13-3Q3SY46 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms