Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LETM2Q2VYF4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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