Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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RRN3P1Q2M238 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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RRN3P1Q2M238 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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RRN3P1Q2M238 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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RRN3P1Q2M238 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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RRN3P1Q2M238 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RRN3P1Q2M238 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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