Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CSPP1Q1MSJ5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms