Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RTL8BQ17RB0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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RTL8BQ17RB0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RTL8BQ17RB0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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