Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms