Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NTRK2Q16620 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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