Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PCSK7Q16549 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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PCSK7Q16549 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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PCSK7Q16549 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PCSK7Q16549 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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