Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NTRK3Q16288 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NTRK3Q16288 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms