Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
USF2Q15853 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USF2Q15853 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USF2Q15853 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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