Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms