Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3AQ14563 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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