Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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