Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKD2Q13563 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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