Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CAMK2BQ13554 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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