Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms