Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPA4Q13156 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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