Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHAF1BQ13112 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms