Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHAF1AQ13111 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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