Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MRPL28Q13084 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms