Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN2AQ12879 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN2AQ12879 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms