Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CDH17Q12864 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDH17Q12864 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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