Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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STX4Q12846 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
STX4Q12846 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms