Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms